氣相色譜柱的極性和非極性主要有柱種類、分離順序、柱溫三種區別。
1、柱種類不同：
氣相色譜柱非極性固定液的柱子包括烴類和硅氧烷類；氣相色譜柱極性固定液的柱子主要是聚乙二醇類。
2、分離順序不同：
氣相色譜柱非極性柱分離順序主要是根據試液沸點，而氣相色譜柱極性柱子分離順序除了沸點之外還和物質的極性有關系。
3、柱溫不同：
氣相色譜柱極性柱子的使用溫度比氣相色譜柱非極性柱子的使用溫度更低，這特性使得氣相色譜柱非極性柱子更適合沸點高的物質分析。
氣相色譜柱分為哪幾種
1. 按柱粗細可分為一般填充柱和毛細管柱兩類。
填充色譜柱：多用內徑4～6mm的不銹鋼管制成螺旋形柱管，常用柱長2～4m。填充液體固定相（氣-液色譜）或固體固定相（氣-固色譜）。
毛細管色譜柱：柱管為毛細管，常用內徑0.1～0.5mm的玻璃或彈性石英毛細管，柱長幾十米至百米。
毛細管色譜柱按填充方式可分為開管毛細柱及填充毛細柱。
2. 按分離機制可分為分配柱和吸附柱等，它們的區別主要在于固定相。
分配柱：一般是將固定液（高沸點液體）涂漬在載體上，構成液體固定相，利用組分的分配系數差別而實現分離。將固定液的官能團通過化學鍵結合在載體表面，稱為化學鍵合相（chemically bonded phase），不流失是其優點。
吸附柱：將吸附劑裝入色譜柱而構成，利用組分的吸附系數的差別而實現分離。除吸附劑外，固體固定相還包括分子篩與高分子多孔小球等。
一般情況來說，常用的還是非極性氣相色譜柱，但不能說用通用或不通用來解釋。
這是因為，我們知道，一般性況下，在相同的條件下物質的極性越強，雜原子越多，越容易發生反應，所以相對于非極性色譜柱，極性色譜柱的使用壽命一般更短，更易損壞，使用溫度更低一些。
如果能夠達到分離要求，我們當然要使用更耐用的非極性色譜柱了。所以，我們一般使用氣相色譜柱還是使用非極性色譜柱多一些，也就是一般相對來說的通用的色譜柱了。
但我們有很多情況下，在分離極性物質時因為分離問題要必須使用極性色譜柱才能達到分離要求，而這時，用極性色柱卻成了通用色譜柱了。
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